Vieraskynä Viron ortodoksinen kirkko menetti itsenäisyytensä ja tuli hiippakuntana liitetyksi Moskovan patriarkaattiin 1945 Neuvostoliiton miehitettyä maan. Se oli Suomen kirkon tavoin ollut vuodesta 1923 Konstantinopolin ekumeenisen patriarkaatin alainen autonominen eli itsehallinnollinen kirkko.