Vuonna 1912 antikvaaristen kirjojen kerääjä Wilfrid M. Voynich löysi Villa Mondragonin jesuiittakollegesta Italian Frascatissa oudon käsikirjoituksen. Siitä lähtien se on kummastuttanut historioitsijoita ja salakirjoitusten tutkijoita.
Sen jälkiä on voitu seurata vuoteen 1586, mutta se saattaa olla paljon vanhempikin.